El Programa de Biodiversitat de l’Institut de Biologia Evolutiva (IBE; CSIC-UPF) organitza la primera edició del curs AGCTually Annotating Genomes, una iniciativa impulsada pels estudiants que ofereix formació intensiva en tècniques d’anotació genòmica.

El curs tindrà lloc del 5 al 10 de maig de 2025 a la Universitat Pompeu Fabra (UPF), i s’adreça especialment a investigadors i investigadores postdoctorals, doctorands, estudiants de màster i personal tècnic del programa de Biodiversitat de l’IBE. L’horari serà de 9.30 a 17.00 h, amb sessions teòriques i pràctiques.

Formació avançada en anotació genòmica

L’objectiu del curs és proporcionar als participants coneixements punters en l’anotació estructural i funcional de genomes, així com compartir metodologies i eines capdavanteres en el camp. L’activitat busca també enfortir la comunitat investigadora internacional dedicada a la genòmica de la biodiversitat.

"Es van necessitar 248 autors per anotar el genoma humà; ara, només un de vosaltres ho pot fer".

Un programa amb experts internacionals

El programa compta amb la participació de reconeguts especialistes internacionals com Aureliano Bombarely, Katharina Hoff, Yannis Nevers, Ana Rojas, Pablo Atienza i Ana Conesa, que impartiran tallers i conferències sobre temàtiques capdavanteres en anotació genòmica:

• Genome assembly using long reads (Aureliano Bombarely)
• Quality Evaluation for Genomes (Aureliano Bombarely)
• Annotation of Protein Coding Genes (Katharina Hoff)
• Hands-on Genome Annotation Tutorial (Katharina Hoff)
• Annotation using long read technology (Ana Conesa and Pablo Atienza)
• Functional ANnoTAtion based on embedding space SimilArity (Ana Rojas)
• Leveraging evolutionary information to build a consensus annotation with OMAnnotator (Yannis Nevers)
• Structural genome annotation with Helixer (Aureliano Bombarely)
• Structural genome annotation QC (Aureliano Bombarely)

Aquestes sessions combinen teoria i pràctica, amb un enfocament aplicat per a l’anotació genòmica utilitzant eines de darrera generació.

Programa del curs "AGCTually Annotating Genomes"

La iniciativa ha rebut el finançament de la Secretaria d’Universitats i Recerca del Departament d’Economia i Coneixement de la Generalitat de Catalunya (AGAUR 2021-SGR00420) i la Universitat Pompeu Fabra (UPF).